Profiling of Pluripotency Factors in Single Cells and Early Embryos.
Profiling of Pluripotency Factors in Single Cells and Early Embryos.
細胞運命の決定は、胚発生の中の細胞小集団において作用するsequence-specific transcription factors (TFs)(配列特異的転写因子)により制御されている。In vivoにおけるその機能を理解するには、これらの細胞における転写因子binding sites(結合部位)を同定する必要がある。しかしこれまでの方法では、転写因子を単一細胞レベルで、あるいはその近くでゲノムワイドにプロファイルすることはできなかった。今回我々は、1つの細胞あるいは着床前の個別胚など少ない細胞数で転写因子をプロファイルするための方法としてthe cleavage under targets and release using nuclease (CUT&RUN) methodを提示する。単一細胞実験により、ほんの少数の転写因子結合部位がほとんどの細胞で占められていることが示唆された。これは多細胞研究におけるピーク強度測定結果とも広く一致している。さらに我々は、多能性TF NANGOによるクロマチン結合は個々の胚盤胞におけるSWI/SNFに強く依存しているにもかかわらず培養細胞においてはそうではないことを今回提示する。すなわちUltra-low input CUT&RUN (uliCUT&RUN)は、様々な疾患や発生過程において重要だが希少な細胞集団におけるTF結合の同定を可能にすることができる。
