Integrated Single-Cell Analysis Maps the Continuous Regulatory Landscape of Human Hematopoietic Differentiation.
Integrated Single-Cell Analysis Maps the Continuous Regulatory Landscape of Human Hematopoietic Differentiation.
Buenrostro JD1, Corces MR2, Lareau CA3, Wu B4, Schep AN4, Aryee MJ5, Majeti R6, Chang HY7, Greenleaf WJ8.
ヒト造血幹細胞は、多能性細胞がより系統が制限された状態へと細胞分化していく過程を含んでいる。このプロセスのクロマチンアクセシビリティ空間配置は特定の細胞集団で研究されているが、単一細胞の変化は集団平均の陰に隠れてきた。私たちは、単一細胞クロマチンアクセシビリティ情報を、ヒト造血幹細胞の免疫表現型からヒト造血幹細胞と定義された10の細胞集団から収集し、細胞分化の軌跡を特徴づけるヒト造血幹細胞のクロマチンアクセシビリティ空間配置像を構築した。私達は、多能性細胞の異なる分化発達系統への偏りと一致する変化を発見した。私たちは、骨髄球性共通前駆細胞(CMP)と顆粒球-マクロファージ前駆細胞(GMP)の不均一性を観察し、分化軌道に沿ってGMPを分割する戦略を開発に成功した。さらに、単細胞RNAシークエンシングデータと統合し、転写因子と、クロマチンアクセシビリティの変化および標的遺伝子に対する調整因子を、発現・抑制因子アクセシビリティの相互関係を通して関連付けた。包括的に、今回の研究は単相某レベルでのヒトの原子組織における複雑な調節動態の統合的探索のための枠組みを提供する。